1.3.2 操作界面
选择欢迎界面左侧的Column(纵列)标签,选中Start with sample data to follow a tutorial单选按钮,选择Select a tutorial data set→T tests→t test - Unpaired(非配对t检验)选项,然后单击Create按钮,如图1-3-5所示,就会创建一个项目(Project),进入软件的操作界面。
图1-3-5 利用软件自带数据创建一个项目
在介绍GraphPad Prism的操作界面之前,建议先把整个项目保存到磁盘中。选择File(文件)→Save(保存)命令,将文件命名后保存为.pzfx格式的原始文件,如图1-3-6所示。也可以单击下面要介绍的工具栏中的保存图标进行保存。在保存项目之后,软件默认每隔5分钟自动备份一次,可以避免因不当操作而导致的软件崩溃或断电等意外情况造成的数据丢失,建议用户养成在新建项目之后就保存项目的习惯。
图1-3-6 保存项目
GraphPad Prism的操作界面和常规软件的差不多,从上到下依次是菜单栏、工具栏、工作区和状态栏,其中,工作区左侧有一个导航栏,用来辅助工作区进行快速切换,如图1-3-7所示。需要注意的是,图1-3-7中的黄色提示框在正常创建的项目中是没有的,而是使用示例数据所独有的,可以单击其右上角的最小化图标,将该提示框隐藏起来。这种提示框(或悬浮笔记)可以通过在工具栏的Sheet选项组中单击图标并选择不同的颜色来建立,也可以在提示框(或悬浮笔记)中右击,在弹出的快捷菜单中选择相应的命令,从而删除提示框(或悬浮笔记)或更改颜色。在实际数据分析过程中,可以方便地添加备注信息。
图1-3-7 操作界面
1. 菜单栏
与其他常规软件一样,菜单栏按照软件功能分组排列,为软件的绝大多数功能提供入口。在菜单栏中选择任一菜单命令,可显示其下拉菜单,在下拉菜单中选择相应的命令即可完成操作,如图1-3-8所示,但直接使用菜单栏完成操作的频率较低,而且越往右的菜单命令的使用频率越低。
图1-3-8 菜单命令及其下拉菜单
2. 工具栏
工具栏把高频使用的软件命令通过图标按钮的形式集中显示出来,大多数操作可以在这里快速完成。
对于不同的表单,工具栏显示的工具会有所区别。如图1-3-9所示,对于Data Tables(数据表),Change选项组主要是关于数据表种类更换、数据表增减行列、排序一类的数据操作,右边的Import选项组可以快速从外部导入其他格式的数据表格,Draw选项组则是灰色的,表示不可用;而切换到Graphs(图形)时,相应的Change选项组变成了关于更改图形样式、设置图形格式等一系列操作,Import选项组变成了Arrange选项组,Draw选项组也变得可以使用。由于工具栏内容较多,在后面的内容中会结合实例再继续介绍。
图1-3-9 Data Tables和Graphs下工具栏的差异
3. 工作区
工作区是软件处理数据并进行数据可视化的区域,是整个软件使用频率最高的区域。
工作区左侧有一个导航栏,这里清楚地列出了GraphPad Prism中一个Project(项目)的5个组成部分——Data Tables(数据表)、Info(信息表)、Results(结果)、Graphs(图形)、Layouts(排版),以及最下面用来管理这5个组成部分之间关联关系的Family(组织或族)。同时,可以通过单击左下角的按钮隐藏导航栏,如图1-3-10所示。
(1)Data Tables(数据表):该部分用于放置项目中的各种数据表,每种数据表的形式可以是8种数据表中的任意一种。每种数据表在右侧有对应的数据组织和输入形式,是整个软件进行统计分析和作图的基础。每种数据表及其他4个部分都可以通过右击并在弹出的快捷菜单中选择Rename sheet命令,或者双击标题中的文字部分进行重命名。
如果发现欢迎界面的数据输入形式选择错误,则可以在已经打开的数据表中进行更改,如图1-3-11所示:①在工具栏的Change选项组中单击图标,即可再次弹出欢迎界面,可以对数据表的类型和样式进行更改;②在没有对数据表进行任何更改的情况下,单击数据表左上角的Table format按钮,同样可以弹出欢迎界面,并对数据表进行更改。
图1-3-10 隐藏导航栏
图1-3-11 更改数据表形式的方法1
双击数据表中第二行带有浅灰色Title字样的任意一格(即每一列的列标题),可以进入列标题修改界面,如图1-3-12(a)所示;双击数据表中第三行(即列标题下一行)及表格行号上面用于选择整个表格的矩形区域,可以进入子列标题修改界面,如图1-3-12(b)所示。这两个界面除了可以对文字内容进行修改,还可以对文字格式进行修改,如加粗、斜体、下画线、上下标等。
图1-3-12 数据表列标题和子列标题修改界面
进入列标题或子列标题修改界面后,都可以切换到如图1-3-13所示的Format Data Table界面,该界面的外观与图1-3-11的欢迎界面不同,但内容相同,甚至更丰富,同样可以修改数据表的类型和样式。此外,如果显示了列标题或子列标题(不需要修改)以及录入了数据之后,再次单击数据表左上角的Table format按钮,也会进入Format Data Table界面,而不再显示图1-3-11的欢迎界面。
图1-3-13 更改数据表形式的方法2
选择Data Tables→New Data Table选项,可以进入欢迎界面,创建新的数据表,如图1-3-14所示,对其他4个部分也可以通过这种方法快速创建新的表单。
图1-3-14 创建新的数据表
此外,可以通过单击工具栏中的图标快速创建新的表单,如图1-3-15所示。在项目的5个部分下面都可以创建不同的新表单,比如,在Data Tables(数据表)下面可以创建不超过1024个(GraphPad Prism 9)数据表,其他4个部分也是如此。
图1-3-15 快速创建新的表单
(2)Info(信息表):该部分用于记录数据分析过程及实验设计的一些信息,以备检查,用户需要根据自己的实际情况填写,如图1-3-16所示。
图1-3-16 信息表
(3)Results(结果):该部分用于记录统计分析的结果。可以选择New Analysis选项,在弹出的界面中选择需要分析的数据表,选择统计分析方法,选择分析的数据集,完成统计分析,如图1-3-17所示。此外,也可以在选中所需数据表的同时,单击工具栏中的图标进行分析。
图1-3-17 统计分析
本例使用Unpaired t test data示例数据,并且全部采用默认设置,很快就能得到分析结果,如图1-3-18所示。如果对分析过程中设置的参数不满意,则可以回到Results的分析结果表单,单击左上角标注分析名称的图标,重新打开数据分析的参数设置界面,修改参数。如果对统计分析方法和分析结果有疑问,则单击工具栏中的图标,将会打开一个界面,并显示所采用的统计分析方法和判断指标的解释说明。
图1-3-18 分析结果
(4)Graphs(图形):在数据表中输入数据之后,Info(默认只有建立项目的时间)和Results中没有内容,GraphPad Prism会自动创建一个和数据表同名的图形表单,但图形的样式并没有确定。在初次单击图形名称时会跳出图形选择引导界面,如图1-3-19所示,供用户选择合适的图形样式。在图形绘制完成之后,再次单击图形名称则只起到一个导航定位的作用。如果需要更改图形样式,则需要在工具栏的Change选项组中单击第一个Choose a different type of graph图标。GraphPad Prism的图形快速绘制功能非常强大,除非有个性化设计要求,几乎可以实现即出即用。
图1-3-19 图形选择引导界面
(5)Layouts(排版):该部分用于直接在GraphPad Prism中进行多个小图或表格的排版组图,生成符合出版要求的大图。选择New Layout选项,激活排版界面,根据项目实际情况创建图形排版,如图1-3-20所示。
图1-3-20 创建图形排版
Page options(页面选项):可以设置排版页面是纵向(Portrait)的还是横向(Landscape)的,设置背景颜色(Background color),设置是否包括每个图形页顶部的主标题(Include master title on top of page),下面两个选项一般保持默认。
Arrangement of graphs(图形排列):软件默认选中Standard arrangement(标准排列)单选按钮,并内置了一些排列方式(见图1-3-20),可以选择直接套用。如果想要使用其他排列方式,则选中Array of graphs:_across by _down单选按钮,可自定义图形排列矩阵,后面的数据表示n列×m行。或者选中Blank layout for drawing and image layout单选按钮,可采用空白版面,自由排列图形和图像。
Graphs or placeholders(图形或占位符):软件默认选中Placeholders only. Add graphs later one at a time(仅占位,稍后逐个添加图形)单选按钮,可生成由浅灰色占位块表示图形的布局。在排版工作区中,可以通过双击浅灰色占位块来选择需要放置的图形,也可以从左边的导航栏中直接拖动图形到相应的位置。推荐使用双击浅灰色占位块的方式选择图形,因为双击占位块后会出现图形选择界面,在该界面中可以对图形进行预览,如图1-3-21所示,方便选择需要排版的图形。
图1-3-21 图形选择界面
导入的图形会被限制在浅灰色占位块的大小范围内,可以直接通过拖曳对角的方式进行缩放或拖曳图形的方式进行位置移动;浅灰色占位块可以被直接删除,如图1-3-22所示。
如果选中了Fill the layout with graphs, starting with(将图形填入排版,从……开始)单选按钮,则需要选择一个起始图形,然后将Graphs部分的图形按照生成的先后顺序自动填入设置好的排版版式中。更多排版内容见9.2节相关内容。
图1-3-22 对图形和占位块进行再次排版
(6)Family(组织或族):导航栏下面的这部分会把相关联的Data Tables(数据表)、Info(信息表)、Results(结果)、Graphs(图形)和Layouts(排版)放在一起,形成一个Family(组织或族)。一般情况下,在数据表被命名之后,后面的信息表、结果和图形默认都会和数据表保持相同的名称,这种一贯性有助于回溯数据可视化的整个过程。但是在数据分析过程中,可能会修改各部分的名称,甚至重复命名,这样混乱的命名方式将导致很难找到相关联的几个部分。而Family可以提供这样的功能,不管如何改名,只要在数据分析和绘图上面存在关联的内容都会被放在一起,当选择某个Family时,其下属的各个表单会加粗显示,如图1-3-23所示。
图1-3-23 Family功能
4. 状态栏
软件的最下方是软件的状态栏,除了指示各个表单的一些状态和提供视图缩放功能,还提供了一些快捷按钮,如图1-3-24所示。这些快捷按钮在其他地方也有实现方式,用户可以根据个人习惯决定是否使用。
图1-3-24 状态栏
:按照从下到上或从上到下的顺序,可切换并浏览导航栏中的所有表单。
:在当前界面和上一次使用的界面之间来回切换,单击一次该按钮可回到上一次使用的界面,再单击一次该按钮可返回当前界面。
:表单缩略图模式,如图1-3-25所示,可以为每部分的多个表单提供缩略图模式,单击任意一个具体的表单即可退出缩略图模式。
图1-3-25 表单缩略图模式
:这5个图标从左到右依次对应导航栏中的5个组成部分,即Data Tables、Info、Results、Graphs、Layouts,分别单击不同的图标可以快速地在GraphPad Prism的5个组成部分之间切换。
:当前部分中的表单切换或重命名。
:快速链接到同一个Family中的表单。